相关研究发现，HLA-B27亚型是由于HLA-B27等位基因多态性而形成，它们之间仅是一个或数个氨基酸的差别，且主要集中在a1、a2结构区内，这些亚型很可能从同一种亚型进化而来。在所有HLA-B27亚型中，B*分布最广，几乎见于所有人种。因此有人推测其他亚型可能都是从B*突变进化而来。
*烽教授及其团队认为，由B*基因发生点突变、基因异位和其他的机制形成各亚型不同的分布频率，各基因亚型之间的差别仅是一个或数个氨基酸。如B*与B*仅差1个氨基酸(AspTyr),B*与B*仅差2个氨基酸(HisAsp,AspTyr),对此解释为，上述差异可能影响了B*和B*对相关肽C末端的结合力。近年随着HLA-B27分型技术提高，不断有新的HLA-B27亚型发现。迄今为止，已经发现的HLA-B27亚型达到了31个，即(HLA-B*-B*,其中B*因为序列错误已被删除)，而且这个数字还在不断增长之中。
HLA-B27亚型具有种族和人种分布不同的流行情况。在所有HLA-B27亚型中B*分布最广，几乎见于所有人种；B*主要存在于白种人、中东犹太人和北非人，B*存在于西非人群中；B*主要限制在东方人和波利尼亚人，其和B*关系密切。B*被证实只存在于东南亚人中；B*在亚洲人群中可检测到（印度、中国、泰国)，但出现频率较低；B*为少见亚型，先从2个英国人中检出，而后有报道从叙利亚正常人群和土耳其人群的As患者中检出；B*则分布在撒丁岛人和意大利本土人；B*、10、11、12、13~25等位基因由于出现频率低或检出时间短分布不详。
在HLA-B27各等位基因与AS关联研究中，B*、B*、B*、B*被认为与AS存在关联；而B*、B*和B*曾被认为与As呈负相关，但在中国北部地区发现了2例B*的AS患者。最近Birinci等人也报道在土耳其人群的AS患者中检出B*,而健康人群对照组中反而未检出，在意大利发现了B*阳性的银屑病关节炎患者。因此B*、B*和B*与AS关系有待进一步研究。其他亚型分布较少，与AS的关联也报道不一，其中已经报道AS患者的亚型有B*、*、*、*、*和*等。
同一亚型在不同人群与AS关联也可不同，白种人与B*和B*相关，其中B*亚型占绝大多数（约96%），其余4%为B*。在高加索人种中B*是最主要的等位基因，占90%左右，B*和B*只在此人种中发现且频率极低；B*是黑种人尤其是西非人的主要亚型，占61%；亚洲人与B*、B*、B*、B*相关，B*约占45%。在中国汉族正常人群中，B*和B*构成了HLA-B27的优势亚型，分别占50.85%和40.68%（共占91.5%）。对中国汉族HLA-B27阳性AS患者的亚型分析显示B*频率最高，占54.8%，其次是B*,占41.1%。同一亚型在不同人群与As关联也可不同，表明亚型与疾病的相关性不是绝对的，可能存在非HLA-B27易感性基因或能地理环境等其他因素的影响。
然而同一人种中As与亚型关联的差别，仅用其他易感基因作用以及地理环境因素不能很好解释，除非易感基因同这种亚型存在连锁不平衡，但目前未有明确的证据。因此有人认为AS关联和不关联HLA-B27亚型的氨基酸差异可能是形成亚型致病性不同的原因，可能是这种结构上的微小改变严重影响了抗原肽的结合方式，使这种亚型递呈的抗原在As病中起作用。但AS与HLA-B27亚型关联仍需进一步研究探讨。
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